해외 데이터베이스

1. Cancer Driver Log (CanDL)

● 연결주소:https://candl.osu.edu/

● 연구기관: Ohio State University (OSU), James Cancer Hospital
● Release Date: 2014
● Recent update : 2015.07.31

☞ pubmed를 기반으로 여러 암종에 대한 62개의 유전자 관련 정보를 제공해주는 데이터베이스

2. Cancer Genome Interpreter

● 연결주소:https://www.cancergenomeinterpreter.org/home

● 연구기관: Universitat Pompeu Fabra, Barcelona, Spain
● Release Date: 2016
● Recent update : 2018.01.17

☞ 246개의 암종, 765개의 암 관련 유전자, 1,631개의 약물 반응성 바이오마커, 5,601개의 검증된 oncogenic alteration을 보유한 데이터 베이스로서 폐암관련 약 32개의 유전자 정보를 제공

3. CIVIC

● 연결주소:https://civicdb.org/home

● 연구기관: Washington University School of Medicine (WashU)
● Release Date: 2016
● Recent update : 2018.07.05

☞ 다양한 종류의 암과 관련된 유전자, 변이 정보와 공공 데이터베이스들의 정보를 통합하여 제공하는 데이터베이스

4. DOCM

● 연결주소:http://www.docm.info

● 연구기관: Washington University School of Medicine
● Release Date: 2015
● Recent update : 2016.06.17

☞ 질병의 원인 돌연변이에 대한 정보를 제공해주는 데이터베이스로서 각 돌연변이에 대한 인용 출처를 링크로 직접 연결하여 검색할 수 있는 변이 목록을 제공
버전 3.2 기준 총 122개의 질병, 132개의 유전자, 1364개의 변이 목록을 보유

5. GDC data portal

● 연결주소:https://portal.gdc.cancer.gov

● 연구기관: NIH
● Release Date: 2018
● Recent update : 2018.06.13

☞ GDC 프로젝트에서 생산된 Sequencing data를 기반한 데이터 포털로서 40개의 프로젝트에서 생산된 22,147개의 유전자와 3,142,246개의 돌연변이 정보를 포함

6. GWAS catalog

● 연결주소:https://www.ebi.ac.uk/gwas

● 연구기관: NHGRI-EBI
● Release Date: 2008
● Recent update : 2018.06.25

☞ Microarray chip을 통한 전장 유전체 연관 연구 결과를 제공하는 데이터 베이스로서 폐암 관련 총 74개의 연구, 1240개의 association, 709개의 유전자에 대한 결과를 소개하는 데이터베이스

7. JAX Clinical Knowledgebase

● 연결주소:https://ckb.jax.org

● 연구기관: Universitat Pompeu Fabra, Barcelona, Spain
● Release Date: 2016
● Recent update : 2018.07.20

☞ 종양과 관련있는 유전자와 변이,치료,진단,예후관련 정보를 제공해주는 데이터베이스
Somatic 유전자의 변이와 단백질 발현을 통한 효과에 대한 최신정보와 유효성 입증 증거를 통해 표적 치료법과 유전자 변이를 연결
총 86개의 유전자, 10,691개의 변이, 12,158개의 molecular profile, 8,531개의 gene level evidence를 보유함

8. OncoKB

● 연결주소:http://oncokb.org/#

● 연구기관: Memorial Sloan Kettering Cancer Center
● Release Date: 2016
● Recent update : 2018.04.04

☞ 특정 암 유전자 변이의 영향과 이에대한 치료관련 정보를 제공해주는 지식기반 데이터베이스
총 519개의 유전자, 4,080개의 alterations, 64개의 암종, 76개의 약물 정보를 보유

9. Phenopedia

● 연결주소:https://phgkb.cdc.gov/PHGKB/startPagePhenoPedia.action

● 연구기관: CDC
● Release Date: 2010
● Recent update : 2018.8.21

☞ 질병의 원인 유전자와 연관된 유전변이 정보에 대한 참조문헌을 제공해주는 데이터베이스
총 3,129개의 질병에 대한 정보가 수록되어있으며 비소세포 폐암에 대한 774개 유전자, 소세포폐암에 대한 194개 유전자 정보 등록

10. My cancer genome

● 연결주소:https://www.mycancergenome.org

● 연구기관: Vanderbilt University
● Release Date: 2010
● Recent update : 2018.04

☞ 의사, 환자, 연구원을 위한 정밀 암 의학지식 자료 데이터베이스로서 어떠한 돌연변이로 인해 암이 생성되는지 관련 최신의 치료정보를 제공 (임상시험 포함)
25개의 질병, 66개의 유전자, 500개의 변이 데이터 보유

11. TumorPortal

● 연결주소:http://www.tumorportal.org

● 연구기관: Broad Institute
● Release Date: 2014
● Recent update : 2016.12.08

☞ 총 22개의 암종에 대한 데이터베이스로서 선암관련 37개의 유전자, 소세포 폐암관련 27개의 유전자 정보를 제공